江苏医药职业学院从2009年开始，集中人力、财力，首期投入400多万元，建成面积400 m2的生物医学技术研究中心，中心已发展成为江苏省博士后创新实践基地，每年1～2名博士后进入基地开展科研工作。依托博士后创新基地科研平台，2018年学校获批江苏省药物一致性评价研究工程中心。在生物医学技术研究中心的基础上，2017年学校成立了校级医药生物技术研究院，实验室规模扩大至3000m2，投入设备专项经费2000余万元，除对原有的分子生物学、形态学等公共实验室进行功能升级外，增设肿瘤、心血管、人体微生态与疾病三个专业实验室。
目前，医药生物技术研究院科研平台建有标准的SPF级实验动物房、细胞培养室，拥有双通道鼠尾无创测量动脉血压设备（CODA2，美国KENT）、血流动力学监测系统（Powerlab PL3508,美国）、应激性高血压造模系统、荧光定量 PCR 仪（qTOWER3/G, 德国耶拿）、荧光倒置显微镜（IX53，日本奥林巴斯）、Leica冰冻切片机、多功能酶标仪（M plex，德国耶拿）、蛋白印迹系统、高速低温离心机、超高速离心机等科研设备。2023年至今新购置的大型设备有：共聚焦激光扫描显微镜+活细胞工作站(LSM900，德国蔡司)、分析分选流式细胞仪（cyFlow Space Sorter，日本希森美康）、厌氧菌培养系统（AW300SG，英国ELECTROTEK）、高速钙离子成像系统（Eclipse Ti2-U，日本尼康）、细胞能量代谢分析系统（XFe96，美国安捷伦）、双色红外激光成像系统（Odyssey Dlx，美国LI-COR）、小动物生理遥测系统（TR190,新西兰Kaha）、小动物心功能检测系统（PL3516, 澳大利亚PowerLab）、小动物活体成像系统（IVIS Lumina III,美国PerkinElmer）、全景切片扫描系统（VS200，日本Olympus）、微量热泳动分子互作仪（Monolith，德国NanoTemper）等。
